JADEの使い方(17)
ユーザデータベースを作成する方法

結晶構造データ(格子定数や原子座標など)を持つCIFファイルを用意することで、JADEのユーザデータベース(ユーザCSD)に登録し、d-I%リストを計算して相同定に利用したり、WPF/Rietveld精密化の計算に利用することができます。

具体的な設定や登録は、以下の手順のように行います。

ユーザCSDを作成

JADEの「データベース」メニューから「ユーザCSDを作成」を選びます。(CSD: Crystal Structure Database)

データベースメニューから実行

ユーザデータベースは複数作成して分類することができます。ここでは新しいユーザデータベースを作成するので、「新しいCSD」をクリックします。

新しいCSDを作成

作成するユーザデータベースに名前を付けます。ほかのデータベースと同じ名前にならないように、名前を付けます

CSDの名前を設定

データベースに登録するデータの内部的な管理番号の開始番号を決めます。JADEに最初から組み込まれているMDI-500というデータベースと番号が重複しないようにするため、「1000」以上の番号を指定してください。

管理番号を設定

あらかじめ用意しておいたCIFファイルを、下図のようにユーザデータベースの管理画面の左側のエリアにドラッグ&ドロップします。複数のファイルやフォルダをドラッグして、一括登録することができます。

CIFファイルをドラッグ&ドロップして追加

CIFファイルのデータがユーザデータベースに登録されます。

登録された結晶構造データの一覧

d-I%リストを作成

登録したデータを相同定などで利用できるようにするため、d-I%リストを算出します。「メニュー」から「d-I%リストを計算する」を選びます。

d-I%リストを計算

計算が終わると下図のように完了を知らせるメッセージが表示されます。

完了のメッセージ

JADEのウィンドウの右下などから、作成したユーザデータベースを利用できるようになります。選択すると、相同定にこのユーザデータベースを利用できます。

使用するデータベースの切り替え

追加したユーザデータベースを選択した状態で、ツールバーの「S/M」ボタンから相同定を行い、「WPF」ボタンでWPF/Rietveld解析を行うと、ユーザデータベースを使い解析を行うことができます。

相同定などに使用できます

 

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